In de historische ruimten van 't Vliegend Peert is een museum gehuisvest dat gebouwd is rond een vaste collectie met langdurige bruiklenen van schilderijen uit de zestiende eeuw. De naam van het museum, Het Zotte Kunstkabinet verwijst naar het specifieke thema van de schilderijen, namelijk satirisch-moraliserend, in de zestiende eeuw ook wel Sot genoemd. Jheronimus Bosch heeft als één der eersten geput uit een beeldentaal die enkele generaties van kunstenaars als Bruegel en Brouwer zal voorzien van metaforen om verwerpelijk gedrag en de bijhorende bestraffing uit te beelden. In het museum wordt duidelijk gemaakt dat deze zotte schilders hun vormentaal niet zelf moesten uitvinden maar te rade konden gaan bij de Middelnederlandse literatuur en teksten uit de rederijkerskamers.
Het centrum staat open voor alle openbare instanties, organisaties of particulieren die advies willen inwinnen wat betreft de authenticiteit en/of conservatie van de kunstwerken die mogelijk dateren uit deze periode en die zij beheren of in hun bezit zijn.
Naast de gespecialiseerde bibliotheek beschikt het centrum voor dit onderzoek tevens over een technisch wetenschappelijk instrumentarium.
Eén van de hoofdobjectieven van het Museum Het Zotte Kunstkabinet is het tonen van de resultaten van deze research aan een groot publiek onder de vorm van tentoonstellingen.